O atual território do Município de Cotriguaçú foi ocupado desde sempre, por nações indígenas, especialmente da língua tupi. Os rikbáktsa também habitaram esta região. Atualmente estão confinados em reservas indígenas especializadas destinada ao seu povo, nos municípios na própria Cotriguaçu. (reserva Indígena escondido). E nos municípios de Juara e Brasnorte.
Com suas formosas particularidades hidrográficas o Rio Juruena permitiu que o município de Cotriguaçú fosse movimentado por viajantes e aventureiros desde o século XVIII.
Em virtude das ocupação total das terras agricultáveis, famílias do oeste paranaense iniciaram o processo de ocupação com interesse voltado apara a agropecuária externa tornando hoje , uma região tomada por mini e pequenos produtores rurais, médios e grandes pecuaristas.
A Cooperativa Central Regional Iguaçu Ltda. (Cotriguaçú) , adquiriu um milhão de hectares no Noroeste Mato-grossense para ser uma opção aos pequenos produtores rurais principalmente para os filhos de associados das cooperativas a ela filiadas.
A colonização do projeto teve início em maio de 1984, com a vinda dos primeiros compradores que puderam perceber rapidamente que se tratava de uma região de terras férteis e com uma fauna riquíssima.
Em a 1986, teve início a construção da cidade de Cotriguaçú, cujo nome é uma homenagem a Central de Cooperativas Cotriguaçú, proprietário do Projeto de Colonização. Com um rápido crescimento da população com a chegada de várias famílias que movimentavam a agricultura, o comércio e a indústria , até dezembro deste mesmo ano, Cotriguaçú experimentou um progresso poucas vezes visto em projeto de colonização, causando problemas para a colonizadora, pois o lugarejo não dispunha de infra-estrutura mínima necessária. Em 1991 , apesar da situação econômica vivida levantou-se o movimento pela emancipação de Cotriguaçú, que veio envolver a população e recitar o ânimo ., pois todos percebiam um grande potencial local. A grande participação popular garantiu esta conquista e em 20 de dezembro de 1991 foi criado o município de Cotriguaçú , com sua instalação em primeiro de janeiro de 1993. A partir daí inicia-se uma nova fase de desenvolvimento. Cotriguaçú possui grande parte de seu território desocupado o que possibilitou a implantação de vários projetos de assentamento do INCRA, fato que atraiu um grande número de famílias oriundas de acampamentos existentes nos municípios de Itaquirai, Bonito, Amambai e outros de Mato Grosso do Sul e muitas famílias de Rondônia. Este grande número de famílias vindas em curto espaço de tempo aumentou significativamente a área ocupada do município criando novas comunidades com destaque para Nova Esperança e a Nova União e ainda um aumento da população urbana de Cotriguaçú e Ouro Verde dos Pioneiros, pois muitas famílias por não terem estradas para seus lotes, e por necessidade de recursos para a sobrevivência imediata ficaram na área urbana trabalhando temporariamente nas madereiras. Quinze anos após seu início, Ctriguaçú tem sua base econômica na indústria madereira que tem sido a responsável pela geração de emprego e renda local. Outra economia que se destaca é a agropecuária que hoje passa ter responsabilidade na economia local, pois alguns fatores como o clima , solo, estrutura fundiária , diversidade de culturas, geram empregos e renda ao Município de Cotriguaçú
Fonte: IBGE