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Iniciou-se a história de São Domingos em meados de 1906, quando Balduino Scheffer vindo do Rio Grande do Sul, instalou-se como primeiro desbravador. Mais tarde, em 1930, a família de Diogo Ribeiro, seguiu o exemplo, e estabeleceu-se na região, constituindo uma fazenda chamada São Domingos.
Os primeiros habitantes do atual município de São Domingos foram italianos, alemães e poloneses, todos procedentes do Rio Grande do Sul.
Em 1937, o povoado passou a ser distrito com o nome de Diogo Ribeiro, pertencendo ao município de Chapecó.
A boa qualidade da terra para a agricultura e a grande quantidade de madeiras, principalmente o pinheiro brasileiro, motivaram a vinda de colonos gaúchos, os quais efetuaram a devastação das matas, instalando diversas indústrias de transformação da madeira e cultivando pequenas propriedades agrícolas por volta de 1942.
Naquele mesmo ano, o distrito passou a ser denominado São Domingos, em homenagem à Fazenda São Domingos que funcionava como sede da localidade.
Gentílico: são dominguense ou dominguense
Formação Administrativa:
Em divisão administrativa referente ao ano de 1933, figura município de Chapecó o distrito de São Domingos.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 31-XII-1937 e 31-XII-1937.
No quadro fixado para vigorar no período de 1944-1948, o distrito de São Domingos figura no município de Chapecó.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1950, o distrito de São Domingos permanece no município de Chapecó.
Pela lei estadual nº 133, de 30-12-1953, transfere-se o distrito de São Domingos do município Chapecó para o de Xaxim.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1955, o distrito de São Domingos figura no município de Xaxim.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 1-VII-1960.
Elevado à categoria de município com a denominação de São Domingos, pela lei estadual nº 804, de 14-12-1962, desmembrado de Xaxim. Sede no antigo distrito de São Domingos. Constituído de distritos: São Domingos e Coronel Martins. Desmembrado de Xaxim. Instalado em 07-04-1963.
Em divisão territorial datada de 31-XII-1963, o município é constituído de 2 distritos: São Domingos e Coronel Martins.
Pela lei estadual nº 1017, de 30-03-1965, é criado o distrito de Maratá e anexado ao município de São Domingos.
Em divisão territorial datada de 1-I-1979, o município é constituído de 3 distritos: São Domingos, Coronel Martins e Maratá.
Pela lei 902/91, de 20 -XII-1991 , é criado o distrito de Vila Milani.
Através da lei estadual nº 8551, de 30-03-1992, desmembra-se do município de São Domingos o distrito de Coronel Martins. Elevado à categoria de município.
Em divisão territorial datada de 1-VI-1995, o município é constituído de 2 distritos: São Domingos e Maratá. Assim permanecendo em divisão territorial datada de 14-V-2001.
Fonte: IBGE